最关键的差异是，马拉松跑者必须尽可能发挥其高效率的能量输出，并在既定的配速下尽可能减少能量消耗，跑得必须更经济些。而在超马项目，效率是其次重点，重点是如何减少肌肉的疲劳、稳定控制不让累积的乳酸操爆肉体。速度是最根本的基础特质，但不代表你能用马拉松配速去挑战超级马拉松。
几个权衡做为你挑战马拉松及超级马拉松的因素：
腿部肌肉量
瘦削的双腿跑起来很有效率，但厚实肌肉的双腿更能耐得住长时间与长距离的冲击。比照起菁英选手里，超级马拉松好手的大腿尺寸比马拉松好手粗上一些。对于超马跑者而言，适当的阻力式、使用机器设备的重量训练做肌肥大的调整是非常重要的。
超级马拉松跑者要做的：稍重的重量训练、增加大腿围的尺寸、吃多一点
跑步步频
在马拉松训练里，一分钟必须满足180步的步频是个常规的概念。但为了减少冲击力等因素，许多多日赛的跑者及超马跑者的步频甚至不到165步。毕竟超级马拉松仍是讲究速度上的挑战，所以许多有经验的跑者会分别应用不同频率的步频作为调整。
超级马拉松跑者要做的：学习感受不同步频的节奏
肌肉柔软度
坚韧的肌肉与肌腱动作起来像是储存着能量，并随时将这些动能转回给每一步伐。但许多资料与证据说明，更好的肌肉柔软度更适合长时间运动，并能减少离心运动(跑下坡)的肌肉损伤。
超级马拉松跑者要做的：柔软操或是瑜珈
落脚表现
马拉松跑者的落脚表现多半在中足(全脚掌)或是前脚掌位置，对小腿阿基里斯腱会渐渐造成负担。而在超级马拉松赛程里，全脚掌、前脚掌及脚跟都必须派上用场，许多好手在赛事末段也会引用脚跟落地的方式持续推进。
超级马拉松跑者要做的：学习感受不同角度落地的冲击感，以及落地后的身体重心移动
跑鞋遴选
早期把跑鞋分类为慢跑鞋、路跑鞋、马拉松鞋，建议马拉松跑者可以穿马拉松鞋、极简鞋作为追速的用鞋。但最近报告里，高避震性的Hoka one one款鞋也可以用作马拉松及超级马拉松赛事。多余重量也许是个问题，但有效能减少腿部肌肉的疲劳是很有对应价值的折衷选择。
超级马拉松跑者要做的：以功能角度去认识跑鞋
心跳率
在马拉松跑者的竞赛心跳率，会尽可能维持在某个平稳的高峰值上。一来不让自己因为过度配速而掉入过氧化陷阱。二来稳定的心跳也能有效地代谢乳酸。但超级马拉松跑者会因应赛事而有不同的表现，距离越长心跳会随着时间延长而逐渐提升；攀爬高度越陡峭，心跳率会急速攀升。心跳的控制较为困难，所以才显得心肺训练格外重要。
超级马拉松跑者要做的：学习解构运动自觉强度或是使用心跳錶
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